深孔钻头要用专门的包装盒包装，防止震动相互碰撞。使用深孔钻头时，应将从包装箱中取出的钻头放入主轴的弹性夹头中或自动更换钻头的刀片。用后放回包装盒。要准确测量钻头直径，应使用工具显微镜等非接触式检测仪器，防止因接触脚踏检测仪而伤及钻刃。
深孔钻头有些厂家的数控钻床应用了定位环，有些数控钻床没有。例如，如果使用定位环，安装过程中的深度定位必须准确。如果没有使用定位环，安装在主轴上的钻头的延伸长度应该调整到一致。多轴刨床更要注意这一点，每个主轴的钻孔深度要一致。如果不一致，可能会导致钻头钻入柜台或钻不透pcb电路板，造成损坏。通常，可以使用40x立体显微镜来检查钻头钻刃的磨损情况。
基础钢板层压包括上下垫块，在刨床工作台上的一孔一槽手机定位系统中应定位牢固、准确。在使用胶粘产品时，要避免钻头粘在胶带上，导致铣钻困难和断钻。在购买厂家的钻头时，需要在进厂检测时抽样检查是否有4%符合要求。并用10 ~ 15倍的光学显微镜100%检查其空位、划痕和裂纹。钻头的适度重磨可以提高钻头的使用和重磨频率，增加钻头的使用寿命，降低产品成本和费用。用通用显微镜测量，在两个主要钻孔刃的总长度内，磨损深度应小于0.2毫米。重磨时，应去除0.25毫米。一般的固定柄钻头可以重磨三次，铲头钻头可以重磨两次。打磨过多会降低冲压质量和精度，导致pcb电路板产品损坏。过度打磨的实际效果得不偿失。
经常检查主轴和弹性卡盘的同轴度以及弹性卡盘的夹紧力。同轴度不好会导致小直径钻断钻，直径大，夹紧力不好会导致比转速比与设定转速比有偏差。固定柄钻在弹性卡盘上的夹紧长度为钻柄直径的4 ~ 5倍，才能夹紧牢固。务必检查主轴压脚。压脚表面应水平并垂直于主轴，不允许晃动，以免钻孔时出现钻孔破损和孔偏。刨床的实际除尘效果更好。除尘风可以降低钻头温度，朋友带烟尘减少摩擦造成高温。